ההבדל העיקרי בין אלקטרופורזה 1D ל- 2D ג'ל הוא המאפיינים המשמשים להפרדת חלבונים על אלקטרופורזה ג'ל. אלקטרופורזה ג'ל 1D מפרידה רק חלבונים על בסיס המשקל המולקולרי ואילו אלקטרופורזה של ג'ל 2D מפרידה בין חלבונים על בסיס הנקודה האיזו-חשמלית ומשקלה מולקולרי.

הפרדת חלבונים על ידי אלקטרופורזה של ג'ל היא טכניקה חשובה לאפיון חלבונים. לחלבונים יש תכונות משתנות; לפיכך, ההפרדה מורכבת יותר בהשוואה להפרדת DNA על ידי אלקטרופורזה של ג'ל Agarose.

תוכן

1. סקירה כללית והבדל מפתח
2. מה זה אלקטרופורזה ג'ל 1D
3. מה זה אלקטרופורזה ג'ל 2D
4. קווי דמיון בין אלקטרופורזה לג'ל 1D ו- 2D
5. השוואה זו לצד זו - אלקטרופורזה 1D לעומת 2D ג'ל בצורה טבלאית
6. סיכום

מה זה אלקטרופורזה ג'ל 1D?

אלקטרופורזה ג'ל 1D, הידועה גם בשם אלקטרופורזה ג'ל ממד אחד, היא שיטת הפרדת חלבון על בסיס המשקל המולקולרי. הפרדת חלבונים מתרחשת בעיקר באמצעות אלקטרופורזה של ג'ל פוליאקרילמיד. בהתבסס על הרעיון של אלקטרופורזה ג'ל, מולקולות נפרדות על תכונותיהן של משקל מולקולרי ומטען.

לכן, כדי לתת מטען אחיד לחלבונים, הטיפול בסודיום דודציל סולפט (SDS) נעשה לפני האלקטרופורזה בג'ל. SDS מכחיש חלבונים ומספק מטען שלילי אחיד על החלבון; כאשר יישום השדה החשמלי מתרחש, החלבונים נודדים לטרמינל החיובי על סמך משקלם המולקולרי. כך, בהפרדה, נחשב רק נכס אחד. זו הסיבה ששיטה זו מכונה אלקטרופורזה ג'ל 1D.

במהלך אלקטרופורזה של ג'ל 1D, מופרדים חלבונים על סמך משקלם המולקולרי. בהקשר זה, מולקולות המשקל הנמוך נודדות מהר יותר בג'ל בהשוואה לחלבונים בעלי משקל מולקולרי גבוה. כך, חלבונים בעלי משקל גבוה נשארים קרובים לבארות.

מה זה אלקטרופורזה ג'ל דו-ממדי?

אלקטרופורזה ג'ל דו-ממדי או אלקטרופורזה ג'ל דו ממדית מפרידות חלבונים על בסיס שתי תכונות. שתי המאפיינים הם הנקודה האיזו-חשמלית של החלבון והמשקל המולקולרי. שיטה זו של הפרדת חלבונים מגבירה את הרזולוציה של הפרדת חלבון. הנקודה האיזו-חשמלית של החלבון תלויה ב- pH בו החלבון ניטרלי.

כך, באלקטרופורזה של ג'ל דו-ממדי, מותר לחלבון לפעול על שיפוע pH קבוע בממד הראשון. בממד השני מופרדים החלבונים באמצעות אלקטרופורזה ג'ל פוליאקרילאמיד אנכי או אופקי. כך, החלבונים נפרדים בהתאם למשקלם המולקולרי בממד השני.

חוץ מזה, שיטה זו של אלקטרופורזה ג'ל מגדילה את הרזולוציה של הפרדת חלבון. לכן החלבונים המופרדים הם טהורים יותר. עם זאת, עלות הטכניקה גבוהה בהרבה מאלקטרופורזה בגודל ג'ל.

מה הדמיון בין אלקטרופורזה לג'ל דו-מימדי ו -2-ד '?

  • שתי הטכניקות מפרידות בין חלבונים. מכאן שהם חשובים באפיון חלבונים.

מה ההבדל בין אלקטרופורזה לג'ל דו-מימדי לדו-מימד?

ההבדל העיקרי בין אלקטרופורזה לג'ל 1D ו- 2D הוא בכך שהאלקטרופורזה בג'ל 1D מפרידה בין חלבונים המבוססים רק על המשקל המולקולרי ואילו אלקטרופורזה של ג'ל 2D מפרידה בין חלבונים על בסיס נקודה איזו-חשמלית ומשקל מולקולרי כאחד. בשל ההבדל הבסיסי הזה בין אלקטרופורזה של ג'ל דו-מימדי לדו-מימד, גם הרזולוציה של הפרדת החלבונים ועלות שתי הטכניקות משתנות. אלקטרופורזה של ג'ל דו-ממדי מציגה רזולוציה גבוהה יותר מאשר אלקטרופורזה בג'ל 1D. עם זאת, אלקטרופורזה של ג'ל דו-ממדי יקרה יותר מאלקטרופורזה של ג'ל 1D.

להלן אינפוגרפיקה מסכמת את ההבדל בין אלקטרופורזה לג'ל דו-מימדי לדו-מימד.

ההבדל בין אלקטרופורזה לג'ל 1D לבין 2D בצורה טבלאית

סיכום - אלקטרופורזה לג'ל 1D לעומת 2D

הפרדת חלבונים נשענת על גורמים רבים. אלקטרופורזה ג'ל 1D מפרידה בין חלבונים המבוססים רק על המשקל המולקולרי. עם זאת, אלקטרופורזה דו-ממדית או אלקטרופורזה ג'ל דו-ממדי מגדילה את הרזולוציה של הפרדת החלבון. יתר על כן, אלקטרופורזה בג'ל דו-מימדי מפרידה בין חלבונים על בסיס הנקודה האיזו-חשמלית והמשקל המולקולרי. לכן נתונים אלו חשובים לעיבוד במורד הזרם של חלבונים ובתחום הפרוטאומיקה. כך, זהו סיכום ההבדל בין אלקטרופורזה לג'ל דו-מימדי לדו-מימד.

התייחסות:

1. גלבע, נדז'דה ומיכאיל אלטרמן. "השוואה בין אלקטרופורזה ג'ל חד ממדית ושתי מימדית ככלי הפרדה לניתוח פרוטאומי של מיקרוזומי כבד חולדה: ציטוכרומים P450 וחלבוני קרום אחרים." פרוטאומיקה, הספרייה הלאומית האמריקאית לרפואה, יוני 2002, זמינה כאן.

באדיבות תמונה:

1. "אלקטרופורזה - מילוי בארות ג'ל 1D בתערובת חלבונים" מאת ז'אן אטיין פויארייר - מילוי בארות ג'ל 1D בתערובת חלבונים (CC BY-SA 2.0) באמצעות Commons Wikimedia
2. "אלקטרופורזה דו-מימדית" מאת המכון הלאומי לבריאות - המרכז לחקר הסרטן לתוכנית ננו-ביולוגיה, המכון הלאומי לבריאות (רשות הרבים) דרך Commons Wikimedia